黑龍江呼中國家級自然保護區(qū)是大興安嶺野生動物重要棲息地，是野生動物監(jiān)測和珍稀瀕危動物保護、監(jiān)測與恢復的重要基地。據(jù)調(diào)查，保護區(qū)內(nèi)陸棲脊椎動物共計250種，其中鳥類17目45科194種，魚類6目7科14種，兩棲爬行類4目5科6種，獸類6目15科36種。

黑龍江呼中國家級自然保護區(qū)擁有豐富的野生動物資源，具有國家重點保護野生動物65種。其中，國家I級重點保護野生動物11種，包括貂熊、駝鹿、原麝、紫貂、黑嘴松雞、金雕、黑琴雞、東方白鸛等；國家Ⅱ級重點保護野生動物54種，其中包括狼、棕熊、猞猁、雪兔、大天鵝、花尾榛雞、花臉鴨、鴛鴦、鴻雁等。

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