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中國(guó)種子性狀數(shù)據(jù)庫(kù):彌補(bǔ)全球數(shù)據(jù)空白的關(guān)鍵一步

媒體:原創(chuàng)  作者:植物園聯(lián)盟
專業(yè)號(hào):植物園聯(lián)盟 2025/6/18 14:47:57

植物性狀是表征環(huán)境適應(yīng)策略與資源分配模式的關(guān)鍵指標(biāo),為理解物種分布、群落構(gòu)建及生態(tài)系統(tǒng)功能提供了重要基礎(chǔ)。近年來(lái),全球及區(qū)域尺度的植物性狀數(shù)據(jù)庫(kù)不斷完善,推動(dòng)了宏觀生態(tài)學(xué)、功能生態(tài)學(xué)及生物多樣性保護(hù)等領(lǐng)域的發(fā)展。然而,現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)主要聚焦于葉片等生長(zhǎng)器官,種子、果實(shí)等繁殖器官的記錄相對(duì)不足,形成顯著的數(shù)據(jù)短板。此外,數(shù)據(jù)的地域分布極不均衡,部分生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)數(shù)據(jù)匱乏,進(jìn)一步加劇了大尺度生態(tài)學(xué)研究中的地理偏倚問(wèn)題。中國(guó)作為全球生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)之一,擁有逾3.5萬(wàn)種維管植物和多樣化的生態(tài)系統(tǒng),豐富的生物資源促使了大量本土研究的開(kāi)展,相關(guān)成果刊載于眾多中文期刊,積累了數(shù)量可觀的植物傳播體性狀數(shù)據(jù),卻因語(yǔ)言障礙和獲取渠道限制尚未被國(guó)際學(xué)界廣泛利用。

為突破植物傳播體性狀數(shù)據(jù)在數(shù)量和地域分布上的局限,學(xué)科組構(gòu)建了中國(guó)種子性狀數(shù)據(jù)庫(kù)(Chinese Seed Trait Database, CSTD),系統(tǒng)整合了694個(gè)中文數(shù)據(jù)來(lái)源,包括681篇期刊論文、10本專著和3個(gè)在線數(shù)據(jù)庫(kù),共收錄110451條數(shù)據(jù)記錄,涵蓋3897種植物(隸屬1416屬、214科),涉及118項(xiàng)性狀,覆蓋中國(guó)全部生物區(qū)系。

圖一 各式各樣的種子形態(tài)(學(xué)科組拍攝)

圖二 中國(guó)種子性狀數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)框架

數(shù)據(jù)庫(kù)由三大核心模塊構(gòu)成:

(1)采樣地點(diǎn)信息,包括地名、地理坐標(biāo)和氣候數(shù)據(jù)。79%的記錄包含地名信息,66.3%具備精確地理坐標(biāo),數(shù)據(jù)分布橫跨45.6°緯度和6000m海拔范圍,具備顯著的大尺度應(yīng)用潛力。

(2)物種信息,包括分類單元、生活型和生長(zhǎng)型。數(shù)據(jù)庫(kù)廣泛覆蓋植物類群,其中接近40%的物種擁有10種以上性狀記錄,為系統(tǒng)發(fā)育比較分析提供基礎(chǔ)。

(3)性狀信息,包括性狀名稱、具體數(shù)據(jù)及其單位。CSTD收錄的性狀涵蓋形態(tài)、生理、化學(xué)、物候、數(shù)量及傳播六大類,為全面描繪種子性狀綜合征和解析植物繁殖更新策略多樣性提供了重要的數(shù)據(jù)支持。

圖三 中國(guó)種子性狀數(shù)據(jù)庫(kù)的地理及系統(tǒng)發(fā)育分布

中國(guó)種子性狀數(shù)據(jù)庫(kù)屬于完全開(kāi)放獲取,用戶可通過(guò)Shiny交互式網(wǎng)頁(yè)平臺(tái)在線瀏覽、篩選和下載數(shù)據(jù)。歡迎自由使用,使用后請(qǐng)務(wù)必引用原文(Wang HY, Chen XL, Chen SC. 2025. Chinese Seed Trait Database: A curated resource for diaspore traits in the Chinese flora. New Phytologist 247: 1-6. http://doi.org/10.1111/nph.70296)

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CSTD通過(guò)整合中文文獻(xiàn)中海量而分散的傳播體性狀數(shù)據(jù),有效填補(bǔ)了全球植物功能性狀研究中的Raunki?ran短缺,為植物學(xué)、生態(tài)學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)的宏觀研究提供了寶貴資源。未來(lái),CSTD將持續(xù)更新和拓展,誠(chéng)邀全球植物學(xué)家、生態(tài)學(xué)家及相關(guān)研究人員共同參與數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)與完善,推動(dòng)數(shù)據(jù)共享與集成,促進(jìn)全球種子性狀信息的全面整合與深入應(yīng)用。

該研究近日以“Chinese Seed Trait Database: A curated resource for diaspore traits in the Chinese flora”為題發(fā)表于主流期刊New Phytologist。中國(guó)科學(xué)院武漢植物園宏觀生態(tài)學(xué)學(xué)科組博士研究生王昊羽為論文的第一作者,陳思翀研究員為論文的通訊作者,南昌大學(xué)本科生陳雪琳參與了數(shù)據(jù)庫(kù)收集工作。本研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和中國(guó)科學(xué)院“率先行動(dòng)”引才計(jì)劃的資助。

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